В 2003 году построено около 7000 школ, работающих в 20 из 34 провинций, с 27000 преподавателей на 4,2 млн детей (в том числе 1,2 миллиона девочек). Из этого количества около 3,9 млн человек училось в начальных школах. Кабульский университет вновь открыт в 2002 году, в нём обучалось около 24000 студентов, мужчин и женщин. Пять других университетов были восстановлены в начале 2000-х годов.

В 2001 году в государственных школах включены религиозные предметы. В 2003 году, по оценкам, 57 процентов мужчин и 86 процентов женщин были неграмотны, а отсутствие квалифицированной и образованной рабочей силы является одной из основных экономических трудностей. Системой высшего, среднего и специального образования в Афганистане руководят Министерство просвещения и Министерство высшего образования.